Essa dica SANA o problema junto ao processo /usr/sbin/repquota -auv, o qual o cpanel o executa sozinho, do nada (e como quem quer nada), lol, e o pior, não adianta dar killall, kill -9, kill np que ele não encerra, isto é fato!!! Vamos parar de preencher a linguiça e sanar o negócio?
Bem, alguns passos podem ser seguidos para sanar, digamos que irei colocar do nível mais simples ao mais curioso de todos, ok?
Tente o seguinte [como root]:
rm /home/quota.group
rm /home/quota.user
/scripts/fixquotas
Se o processo ainda insistir em ficar como louco checa se seu disco está operando em ready only, uma forma de tentar isto é fazer assim:
touch /home/qualquercoisa e em seguida digitar stat /home/qualquercoisa, se mostrar somente leitura é hora de um reboot (e de preferência um fsck por parte do IDC).
Outro ponto extra é você executar o upcp –force e ver se o processo inicia, caso não, observe na hora (normalmente madrugada) se o processo executa e em seguida opera com o repquota, se isso ocorrer realmente é o versionamento ferrado, mude o estilo de update e faça upcp –force (normalmente release ou stable são os mais recomendados, troque um pelo outro e lembre-se de proteger com chattr os arquivos que lhe são importantes e o cpanel pode os sobrescrever (customizações, por exemplo, em temas do cpanel)).
Vamos finalizar com a dica mais extra?
lsattr /*.user
Se exibir proteções do tipo i–A, meu amigo, tira essa praga daí —-> chattr -iA /*.user
Com isso rode o comando na mão e veja que glorioso.
Se a glória não ocorrer você precisara aprofundar as coisas:
1. Identificar que partições estão usando sistema de quotas,
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root@appunixlabs [~]# cat /etc/fstab | grep quota
LABEL=/ / ext3 defaults,usrquota 1 1
LABEL=/home /home ext3 defaults,usrquota 1 2
LABEL=/usr /usr ext3 defaults,usrquota 1 2
LABEL=/var /var ext3 defaults,usrquota 1 2
================
2. Reiniciar o Servidor e entrar em Single mode.
3. Rodar um fsck para cada partição (modo forçado)-> fsck -f /dev/sdX#
4. Recriar o sistema de journaling para cada partição. (tune2fs -O ^has_journal /dev/sdX#;tune2fs -O has_journal /dev/sdX#)
5. Rodar um fsck PADRÃO para cada partição.
6. rodar o comando /scripts/fixquotas
7. Reiniciar o sistema.
Fonte:
http://www.littleoak.com.br/2011/08/01/usrsbinrepquota-auv-consumindo-toda-cpu-100-overload-cpanel/ (meu velho blog)